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值得注意的是，《征求意见稿》调整了税收优惠政策，增加地方政府对普通住宅、集体房地产享受减免税的权限。

在中央税收优惠层面，延续了现行的免税政策：建造增值率低于20%的保障性住房；因国家建设需要依法征收、收回的房地产。在地方税收优惠层面：将建造增值率未超过20%的普通住宅免税的规定，授权省级政府结合本地实际情况决定减征或是免征；就集体房地产，赋予了省级政府对房地产市场较不发达、地价水平较低地区减征或免征土地增值税的权限。

朱虹认为，《征求意见稿》对决定普通住宅是否予以减免税权限的下放，若未来地方政府对其不予免征，则会造成房地产开发企业的税负增加。

另外，王魏表示，对于以股权转让的方式转让房地产项目是否征收土地增值税的问题，由于此前缺乏国家法律法规层面的明确规定，各地税务机关在文件解读和征收管理上存在差异，给征纳双方都带来不确定性。希望本次在土地增值税立法环节，能对该问题有更明确的指导意见。